RT-LAB的灵活性和开放性使得用户在构建自己的实时系统时可以根据应用的需要自主选择系统构建方式和软硬件模块。尽管如此，我们可以根据应用的经验为用户推荐一些搭建不同系统的指导原则。

在这种配置下，仿真在一台目标机上运行。一台或者多台主机可以通过局域网和目标机连接。在要求实时性能的应用中，目标机运行QNX实时操作系统；如果仅仅作为仿真应用时，目标机上也可以允许Windows NT/2k/XP。对于后者来说，RT-LAB也支持单CPU或多CPU的目标机。

分布式的配置允许将复杂的模型分布到多台PC(目标节点)上并行运算。目标节点之间用IEEE 1394互联，保证节点间实时数据交换迅速可靠。目标机和一台或多台主机通过局域网连接。多节点的模式也可以用于实时应用或者复杂系统的快速仿真。对于前者，目标机运行QNX实时操作系统；对于后者，也可以运行Windows NT/2k/XP，此时也可以支持多CPU目标机。

RT-LAB的多目标机配置可以灵活的应用于大型仿真项目。用户可以用自己的PC搭建多目标机系统并按需要进行扩展；当项目结束后，目标机也可以用于其它的场合。RT-LAB支持多达64台目标节点并行运算。